“Menjadi program studi yang unggul dalam penyelenggaraan pendidikan dan terapan kimia serta berwawasan lingkungan dalam pengembangan IPTEK inovatif.”
Program Studi Kimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Cenderawasih berdiri pada 28 Februari 1998 dan mulai menyelenggarakan pendidikan pada tahun akademik 2000/2001.
Perkembangannya tidak terlepas dari perintisan FMIPA Universitas Cenderawasih melalui kerja sama Universitas Cenderawasih dan CIDA Kanada sejak 1990. Program tersebut mendorong terbentuknya Unit Pelayanan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (UP-MIPA) dan kemudian FMIPA Universitas Cenderawasih.
FMIPA didirikan berdasarkan Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia Nomor 046/O/1998 dan menaungi empat program studi sarjana, yaitu Matematika, Biologi, Kimia, dan Fisika. Izin penyelenggaraan Program Studi Kimia diberikan melalui Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Nomor 3208/D/T/2002 tanggal 28 Oktober 2002.